1970 Sakarya doğumlu olan sanatçı, konservatuvar eğitimini aynı şehirde tamamladı. Bu okulda klasik Türk musikîsinin büyük üstâdlarından Bekir Sıtkı Sezgin, Neyzen Ümit Gürelman, Haydar Sanal, Erol Sayan, Necip Gülses, Hasan Semerkantlı, Faris Akarsu gibi sanatçılardan ders aldı. Mustafa Hakan Alvan, daha sonra İstanbul Üniversitesi Konservatuvarı'nda, TRT İstanbul Radyosu'nda neyzen olarak görev yaptı. 1991'de TC. Kültür ve Turizm Bakanlığı İstanbul Tarihî Türk Müziği Topluluğu'na girdi. Bu yıllarda tasavvuf kültürünün yaşatılması ve dünyaya tanıtılmasında büyük katkısı olan Safer Dal Bey Efendinin teşvikleriyle tasavvuf müziği dalında beste çalışmalarına başladı.
Tasavvuf müziği sahasında 200'ü aşkın bestesi bulunan Mustafa Hakan Alvan İstanbul Tarihî Türk Müziği Topluluğu bünyesinde Ahmet Özhan'la birlikte dünyanın birçok ülkesinde sayısız konser vermiştir. Sanatçı ayrıca tasavvuf müziğinin duayeni Ahmet Özhan'ın solist olduğu Yapı Kredi Bankası 5 CD'lik "Ateş-i Aşk", "Padişah Bestekârlar", "İlâhiyât-ı Ken'ân",4 CD'lik "İrfân-ı Aşk", "Niyâzî-i Mısri","Kerbela Mersiyeleri","Sa¬id Paşa İmamı'mn Şiirlerine Yeni Besteler" ve "Itrî" albümlerini yaptı. Yine Okay Temiz'le "Kuzeyden Güneye Yansımalar" albümü yanısıra; Ruhi Ayangil'in yönetiminde AT-MOKTa Yalçın Tura bestelerinden oluşan "Şeyh Galib'e Saygı Kantatı" ve "Tura Şarkıları" albümlerinde neyzen olarak görev aldı.
Mustafa Hakan Alvan, hâlen Türk Tasavvuf Musikisini Koruma ve Yaşatma Vakfı yanında Boğaziçi Üniversitesi Türk Müziği Kulübü ve Eyüp Sertarikzâde Kültür Merkezi'nde verdiği ney dersleriyle gençlere klasik Türk musikîsi kültürünü aktarmaya çalışmaktadır. Türkân Alvan'la evli olan sanatçı iki çocuk babasıdır.
